При нём в Византии происходила острая борьба между отдельными группировками за власть, выражавшаяся в ряде мятежей крупных феодалов и дворцовых заговорах.

В 1046 г. насильственным путём присоединил к империи Армению. Политика усиления налогового гнёта, религиозных преследований монофизитов, замены военной службы в ополчении денежными платежами, проводившаяся Константин IX Мономах в Армении, привела к ослаблению восточных границ Византии и облегчила наступление турок-сельджуков.

В борьбе с печенегами Константин IX Мономах одержал в 1051 г. победу во Фракии и Македонии, но в 1053 г. византийское войско было полностью разгромлено. При Константине IX Мономахе (в 1054 г.) произошло разделение христианской церкви на западную — католическую и восточную — православную. Умер в том же году. По некоторым данным, имел дочь Анну, выданную замуж за переяславского, затем великого князя Руси Всеволода Ярославича, от брака с которым оставила сына Владимира Мономаха и дочь Анну (Янку).